Jarak Jakarta ke Jogja (Yogyakarta) via jalur selatan adalah sekitar 548 km. Kota-kota yang dilalui adalah : Bekasi, Bandung (via tol Cipularang), Tasikmalaya, Ciamis, Banjar, Gombong, dan Kebumen. Waktu tempuh normal : sekitar 10-11 jam.
Berikut ini peta arah dan jalur dengan kendaraan bermotor (mobil/motor) :
[yogyakarta]Jarak :
Bandingkan : Jakarta – Jogja via jalur utara
[yogyakarta]